Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc6P10629 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxc6P10629 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxc6P10629 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms