Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nid1P10493 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nid1P10493 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms