Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UbbP0CG49 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UbbP0CG49 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms