Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Prm2P07978 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Prm2P07978 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms