Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ifna6P07350 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifna6P07350 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifna6P07350 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms