Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06330 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P06330 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P06330 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P06330 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P06330 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P06330 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P06330 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P06330 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06330 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms