Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P06323 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06323 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06323 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P06323 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06323 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06323 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06323 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06323 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06323 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06323 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06323 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06323 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06323 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06323 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P06323 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P06323 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06323 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms