Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt18P05784 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt18P05784 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt18P05784 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms