Protein–RNA interactions for Protein: P02831

Hoxa3, Homeobox protein Hox-A3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa3P02831 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxa3P02831 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa3P02831 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.5 ms