Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-AaP01910 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-AaP01910 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms