Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01853 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01853 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01853 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01853 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01853 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01853 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01853 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01853 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01853 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01853 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01853 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01853 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01853 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01853 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01853 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01853 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01853 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01853 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01853 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01853 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01853 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms