Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01798 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01798 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01798 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01798 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01798 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01798 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01798 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01798 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P01798 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
P01798 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
P01798 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01798 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01798 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01798 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01798 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
P01798 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
P01798 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
P01798 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
P01798 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
P01798 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms