Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01788 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01788 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01788 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01788 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01788 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01788 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01788 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01788 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01788 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01788 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01788 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01788 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01788 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01788 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms