Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01748 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01748 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01748 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01748 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01748 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01748 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01748 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01748 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01748 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01748 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01748 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01748 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01748 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01748 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01748 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01748 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01748 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms