Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01738 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01738 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01738 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01738 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01738 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01738 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01738 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01738 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01738 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01738 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01738 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01738 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01738 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01738 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01738 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01738 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01738 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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