Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo1O89026 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Robo1O89026 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo1O89026 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo1O89026 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo1O89026 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Robo1O89026 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Robo1O89026 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Robo1O89026 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms