Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn3O88990 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn3O88990 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn3O88990 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn3O88990 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn3O88990 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms