Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apaf1O88879 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Apaf1O88879 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apaf1O88879 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms