Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
JtbO88824 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
JtbO88824 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
JtbO88824 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
JtbO88824 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JtbO88824 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
JtbO88824 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JtbO88824 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JtbO88824 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JtbO88824 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
JtbO88824 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JtbO88824 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JtbO88824 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
JtbO88824 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
JtbO88824 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
JtbO88824 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JtbO88824 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JtbO88824 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms