Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AurkcO88445 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AurkcO88445 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
AurkcO88445 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
AurkcO88445 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms