Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tnnt1O88346 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tnnt1O88346 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tnnt1O88346 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms