Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stag3O70576 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stag3O70576 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Stag3O70576 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag3O70576 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Stag3O70576 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Stag3O70576 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stag3O70576 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms