Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nptx2O70340 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nptx2O70340 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nptx2O70340 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms