Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxq1O70220 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxq1O70220 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms