Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmx1O70218 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hmx1O70218 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hmx1O70218 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms