Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cyp26a1O55127 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cyp26a1O55127 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cyp26a1O55127 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms