Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mmp10O55123 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp10O55123 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp10O55123 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms