Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SlkO54988 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SlkO54988 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SlkO54988 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SlkO54988 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SlkO54988 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SlkO54988 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SlkO54988 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SlkO54988 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SlkO54988 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SlkO54988 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SlkO54988 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SlkO54988 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SlkO54988 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SlkO54988 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SlkO54988 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SlkO54988 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SlkO54988 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SlkO54988 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SlkO54988 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SlkO54988 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SlkO54988 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SlkO54988 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SlkO54988 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SlkO54988 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SlkO54988 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SlkO54988 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SlkO54988 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SlkO54988 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SlkO54988 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SlkO54988 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SlkO54988 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SlkO54988 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms