Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NlkO54949 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NlkO54949 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NlkO54949 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NlkO54949 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NlkO54949 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NlkO54949 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NlkO54949 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NlkO54949 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NlkO54949 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NlkO54949 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NlkO54949 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NlkO54949 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NlkO54949 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms