Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Socs5O54928 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Socs5O54928 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Socs5O54928 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Socs5O54928 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Socs5O54928 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Socs5O54928 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms