Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Srpk2O54781 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srpk2O54781 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srpk2O54781 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms