Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab33bO35963 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rab33bO35963 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rab33bO35963 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms