Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk5r2O35926 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk5r2O35926 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cdk5r2O35926 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms