Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Timm44O35857 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timm44O35857 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Timm44O35857 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm44O35857 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms