Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NudcO35685 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NudcO35685 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NudcO35685 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NudcO35685 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NudcO35685 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NudcO35685 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NudcO35685 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NudcO35685 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NudcO35685 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NudcO35685 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NudcO35685 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NudcO35685 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NudcO35685 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NudcO35685 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NudcO35685 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NudcO35685 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NudcO35685 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NudcO35685 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NudcO35685 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NudcO35685 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NudcO35685 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NudcO35685 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NudcO35685 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NudcO35685 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NudcO35685 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NudcO35685 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms