Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Opn1mwO35599 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Opn1mwO35599 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Opn1mwO35599 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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