Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KeraO35367 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KeraO35367 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KeraO35367 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KeraO35367 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KeraO35367 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KeraO35367 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KeraO35367 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KeraO35367 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KeraO35367 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KeraO35367 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KeraO35367 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KeraO35367 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms