Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ebi3O35228 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ebi3O35228 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms