Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Polr1aO35134 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
Polr1aO35134 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms