Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Casq1O09165 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casq1O09165 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Casq1O09165 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casq1O09165 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms