Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LhbO09108 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LhbO09108 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LhbO09108 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LhbO09108 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LhbO09108 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LhbO09108 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LhbO09108 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LhbO09108 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LhbO09108 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LhbO09108 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LhbO09108 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LhbO09108 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LhbO09108 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LhbO09108 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LhbO09108 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LhbO09108 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LhbO09108 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LhbO09108 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms