Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CltaO08585 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltaO08585 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CltaO08585 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltaO08585 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltaO08585 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CltaO08585 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CltaO08585 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CltaO08585 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltaO08585 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltaO08585 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltaO08585 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltaO08585 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CltaO08585 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltaO08585 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CltaO08585 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CltaO08585 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CltaO08585 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CltaO08585 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CltaO08585 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltaO08585 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltaO08585 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltaO08585 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CltaO08585 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltaO08585 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltaO08585 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CltaO08585 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CltaO08585 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltaO08585 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CltaO08585 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CltaO08585 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CltaO08585 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CltaO08585 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms