Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Sec22bO08547 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sec22bO08547 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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