Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MsmbO08540 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MsmbO08540 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MsmbO08540 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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