Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r80L7N1Z3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vmn1r80L7N1Z3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms