Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm21310J3QQ23 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm21310J3QQ23 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms