Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm9602J3QPD5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm9602J3QPD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms