Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21972J3QN38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21972J3QN38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms