Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6176J3QK59 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm6176J3QK59 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm6176J3QK59 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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