Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21060J3KMU4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21060J3KMU4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms